公章需要存档备案的原因主要有以下几点：
法律合规性：
只有经过备案的公章才是合法的公章，受法律保护。备案过程确保公章的使用是合法、合规的，并方便公安机关对公章的刻制和使用情况进行监督和管理。
唯一性和可追溯性：
备案印章具有全国唯一编码，并录入印章治安管理信息系统，信息同步至银行、市场监管、税务等部门，便于全国范围内查询和验证。
防伪和安全：
备案印章带有编码和防伪纹线，防止伪造和冒用，一旦发生纠纷，公安机关可以快速识别并追究责任。
便于管理：
公章备案有助于公安机关掌握公章的刻制和使用情况，防止非法刻制和滥用，维护社会公共安全和经济秩序。
综上所述，公章存档备案是确保其合法性、防伪性、唯一性和便于管理的重要措施，是维护社会秩序和法治的重要环节。