在法律上，证明股东出资的方式主要有以下几种：
银行转账凭证：
对于货币出资的股东，银行转账凭证是最直接和最核心的证据。股东应确保将出资款足额汇入公司的银行账户，并在汇款时明确备注“投资款”或“出资款”。如果汇款时未备注，则应提供其他证据来证明该款项为出资款，例如涉及投资款性质的聊天记录等。
出资证明书：
根据《公司法》第五十五条的规定，有限责任公司成立后，应当向股东签发出资证明书。出资证明书应详细载明公司名称、公司成立日期、公司注册资本、股东的姓名或名称、认缴和实缴的出资额、出资方式和出资日期以及出资证明书的编号和核发日期，并由法定代表人签名和加盖公司盖章。因此，出资证明书是股东证明自己已经出资的最直接方式，也是公司法规定的认可股东出资的重要文件。
企业年度报告：
企业年度报告是企业向市场监督管理部门报送的年度报告，其中包含股东实缴的出资额、出资时间、出资方式等信息。虽然企业年度报告的证明力相对较弱，但仍可以作为股东出资证明文件的一个重要辅助证据。
股东会决议、公司的会计记录和财务报表：
这些文件也会记载股东的出资情况，虽然不能直接证明股东的出资情况，但可以作为辅助证据使用。
公司章程：
公司章程中会详细记载股东的姓名或名称、出资方式、出资额以及出资时间等信息，通过查阅公司章程，也可以证明股东是否已经履行了出资义务。
出资流水证明：
出资流水是指通过银行账户向公司公账转账的流水记录。如果没有其他材料可以证明，出资流水也可以作为有效证明实缴资本的材料。
非货币出资的评估作价：
如果股东以非货币财产出资，应当依法办理其财产权的转移手续，并由有资质的评估机构进行评估作价。评估作价的结果应作为出资证明书的内容之一。
工商登记：
公司应当将股东的姓名或名称向公司登记机关登记，登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。工商登记的效力在于对抗公司股东以外的第三人。
综上所述，股东可以通过银行转账凭证、出资证明书、企业年度报告、股东会决议、公司的会计记录和财务报表、公司章程、出资流水证明、非货币出资的评估作价以及工商登记等多种方式来证明其已经履行了出资义务。