起诉非法营运需要遵循以下步骤：
收集证据
收集与非法营运行为相关的证据，如交易记录、合同、证人证言等，以证明被告确实从事了违法的营运活动。
确定管辖法院
根据法律规定，向有管辖权的司法机关提起诉讼。通常情况下，这类案件由涉案地的联邦或州法院独立审理。如果被告居住地的法庭具备更优渥的合法性条件，也可以选择以其为主要管辖机构。
提交起诉状
起草并向法院提交起诉状，详细列出诉讼请求、事实和理由。如果书写起诉状有困难，可以口头起诉，由法院记入笔录并通知对方当事人。
法院立案审查
法院将审查提交的起诉状，确认是否符合《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十二条规定的起诉条件，包括原告与案件有直接利害关系、有明确的被告、具体的诉讼请求和事实理由，以及案件属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉法院管辖。
证据交换
法院受理案件后，将通知当事人进行证据交换。当事人应在规定时间内提交证据，并对对方提交的证据进行质证。
排期开庭
法院将根据案件情况排期开庭，并提前通知当事人开庭时间、地点和承办人。
开庭审理
开庭审理包括法庭调查、举证质证、法庭辩论和法庭调解等环节。在庭审过程中，双方当事人应充分陈述事实、提供证据，并对有争议的事实和法律问题进行辩论。
作出判决
法院在审理结束后，将根据案件情况作出判决或调解结果。如果达成调解协议，将制作调解书，双方签字后生效。
执行判决
如果法院判决支持原告的诉讼请求，将依法执行判决，确保被告停止非法营运活动并赔偿原告的经济损失。
建议在整个诉讼过程中，咨询专业律师以获取法律帮助，确保诉讼活动的合法性和有效性。