变性后更改身份证性别的流程通常包括以下几个步骤：
1. 准备材料：
书面申请报告；
申请人居民户口簿和居民身份证；
国内三级医院出具的性别鉴定证明；
公证部门或司法鉴定部门出具的性别变更证明；
未成年人申请还需提供监护人身份证件。
2. 提交申请：
向户口所在地公安派出所提出申请；
填写《居民身份证申领登记表》；
进行现场拍照留底。
3. 审核过程：
派出所受理后进行调查核实；
报县级公安机关审批；
户口所在地公安机关在50个工作日内办结。
4. 领取新证：
审核通过后，申请人可领取新的身份证；
领取新证时，可能需要交回原居民身份证。
请注意，变性手术后，公民身份号码保持不变，但性别信息将更新为变更后的性别。