农业银行转账的到账时间主要取决于转账方式、金额以及是否跨行。以下是具体的到账时间：
同行转账
通过农行ATM机给他人农行储蓄卡或他行卡转账，24小时后到账。
通过农行柜台给农行用户转账，选择实时转账，交易成功即时到账。
通过个人网银或掌上银行同行转账，选择实时转账，交易成功即时到账；选择普通转账，交易成功两个小时后到账；选择次日转账，交易成功24小时后到账。
跨行转账
转账金额5万元以下，受理成功2小时后汇出，工作日一般6小时内可以到账。
转账金额5万元以上，工作日9:00-14:50，基本为2小时后到账，一般情况下3小时内到账。
转账金额5万元以上，工作日9:00-16:50，基本为24小时后到账，一般情况下扣款成功后1小时内到账。
ATM非同名转账，最快24小时后到账。
个人网银、掌银跨行转账（选择普通转账），受理成功2小时后汇出，工作日一般扣款成功汇出后6小时内可以到账。
其他注意事项
如果通过农行电话银行转账，转账金额5万元以下，一般是实时到账；转账金额大于5万元，工作日内差不多1小时内到账。
非工作日不处理转账业务，因此周末、节假日期间转账到账时间会有所推迟。
综上所述，农行转账5万元的到账时间主要取决于转账方式及具体操作时间。建议在工作日进行转账操作，以确保到账速度。