恩施州拥有多种受保护的动物，包括以下几种：
哺乳纲动物
南狐（又名红狐、赤狐、草狐）
貉（又名狸、貉子）
华南黄鼬（又名黄鼠狼）
貂
河北狗獾
花面狸
华南豹猫
灵猫
水獭
云豹
猴
野猪
豪猪
獐
麂
江西草兔
湖北岩松鼠
社鼠
田鼠
家鼠
褐家鼠
蝙蝠
山蝠
刺猬
白鳍豚（水生动物）
江豚（水生动物）
爬行纲动物
蛇
鸟类
彩鹮（国家一级重点保护野生动物）
朱鹮（近亲）
胡子蛙（濒临灭绝，特有珍稀濒危两栖动物）
中华鲟（水中大熊猫）
白颈长尾雉（国家一级保护动物）
其他
金丝猴（如川金丝猴）
黑熊
林麝
金雕
猕猴
鬣羚
大鲵