公司需要交纳的税种主要包括以下几种：
增值税
增值税是根据商品或服务在流转过程中产生的增值额来征收的流转税。一般纳税人的税率是13%，小规模纳税人的税率是3%。
企业所得税
企业所得税是对公司盈利征收的所得税。如果公司年利润在300万元以上，税率为25%；如果年利润在300万元以下，税率为5%。
个人所得税
个人所得税是针对员工工资和股东分红征收的税。公司作为扣缴义务人，需要代扣代缴员工的个人所得税。
附加税
附加税包括城市维护建设税、教育费附加和地方教育费附加，这些税费以实际缴纳的增值税税额为计税依据。
印花税
印花税是对某些特定经济行为征收的税，虽然征税范围有限，但每个公司都会涉及一些。
特殊行业税种
特殊行业可能需要缴纳消费税、资源税等。例如，如果公司经营的是特定消费品，如烟草、酒等，则需要缴纳消费税。如果公司开采销售的是原油、天然气等，则需要缴纳资源税。
其他税种
其他税种还包括房产税、城镇土地使用税、车船税等，这些税种一般企业不涉及，即使涉及，其计征金额很小，对企业影响也很小。
综上所述，公司在运营过程中需要交纳的主要税种包括增值税、企业所得税、个人所得税和附加税。特殊行业可能还需要缴纳其他特定的税种。了解并遵守相关税法规定，对于公司的合规经营和税务优化非常重要。