违规用地的处理方式主要包括以下几种：
罚款：
根据《中华人民共和国土地管理法》及其实施条例，非法占用土地可能会被处以每平方米一定金额的罚款。例如，占用永久基本农田的罚款为每平方米1000元，其他耕地为800元以上1000元以下。
拆除和恢复原状：
对于违反土地利用总体规划擅自改变农用地用途的情况，县级以上人民政府自然资源主管部门会责令拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并恢复土地原状。
没收新建的建筑物和其他设施：
如果新建的建筑物和其他设施符合土地利用总体规划，可能会被没收。
追究刑事责任：
如果违法占用土地的行为构成犯罪，如非法占用耕地、林地等农用地，造成大量毁坏，可能会被追究刑事责任，根据《中华人民共和国刑法》第三百四十二条的规定，可能会被判处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
补办手续和确权登记：
对于存量违法用地，可以通过补办用地手续和确权登记来合法化。
投诉和举报：
个人或组织可以向县级以上人民政府自然资源主管部门投诉或举报违法用地行为，以启动相应的法律程序。
处理违规用地时，应遵循法律规定的程序，并考虑到实际情况，如土地用途变更是否经过批准、是否造成种植条件破坏等因素。处理方式可能因地区和具体情况而异，建议咨询当地自然资源主管部门获取详细信息