当员工起诉公司时，公司应当采取以下步骤来处理：
认真对待并收集证据
公司应首先收集相关证据，包括公司的规章制度、员工的工作记录等。
可以委托专业律师分析起诉原因，制定应对策略。
积极与员工沟通
尝试通过协商解决纠纷，了解员工的诉求，并在必要时进行妥协。
在沟通过程中，公司应保持冷静，避免言辞和态度激化矛盾。
准备应诉
公司应认真梳理相关事实和证据，明确自身的立场和观点。
可以委托专业的法律顾问，指导公司进行诉讼程序的各个环节，包括答辩、举证、质证等。
制定应诉策略
针对员工的请求事项逐一提出答辩意见，按时参加庭审并领取裁决文书（调解文书）。
在诉讼过程中，公司可以委托专业的律师代理，根据法律规定和案件实际情况进行答辩和举证。
遵守法律程序和规定
公司在整个过程中要严格遵守法律程序和规定，确保自身的行为合法合规。
如果公司在诉讼中处于不利地位，也可以考虑通过调解等方式寻求妥善解决的途径。
评估影响并制定预防措施
公司需要评估此次诉讼可能对公司造成的声誉影响和经济损失，并提前制定多种应对方案。
通过内部调查查明事实真相，制定合理的应诉策略，以最大程度地维护公司的合法权益。
执行判决并反思
无论判决结果如何，公司都应认真对待判决，并采取相应措施。
公司可以检讨人力资源政策和惯例，提高员工满意度和工作场所文化，预防类似情况的再次发生。
通过以上步骤，公司可以更加有效地应对员工起诉，维护自身的合法权益，并减少不必要的法律风险和经济损失。