商铺增值税的计算方法如下：
增值税计算公式
若提供上手购房发票，增值税计算公式为：
\[ \text{增值税} = \frac{\text{转让收入} - \text{上手发票价} \times （1 + 5\%） - \text{相关税金}}{1 + 5\%} \times 5\% \]
若不能提供上手购房发票，增值税计算公式为：
\[ \text{增值税} = \frac{\text{转让收入} - \text{转让收入} \times 90\%}{1 + 5\%} \times 5\% \]
附加税费计算
城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加的计算公式为：
\[ \text{附加税费} = \text{增值税额} \times \text{相应税率} \]
其中，城市维护建设税税率为7%（城市）、5%（县城、镇）、1%（农村）；教育费附加和地方教育附加的税率分别为3%和2%。
土地增值税计算
土地增值税的计算公式为：
\[ \text{土地增值税} = \text{增值额} \times \text{适用税率} \]
增值额的计算公式为：
\[ \text{增值额} = \text{销售收入} - \text{扣除项目金额} \]
销售收入包括货币收入、实物收入和其他收入。
扣除项目通常包括土地成本、房屋开发成本、费用扣除（如10%）和加计扣除（如20%）以及税金。
个人所得税计算
个人所得税的计算公式为：
\[ \text{个人所得税} = \text{净收入} \times 20\% \]
或者
\[ \text{个人所得税} = \text{转让收入} \times 7.5\% \times 20\% \]
其中，净收入是指转让收入减去房产原值和合理费用。
请注意，以上计算方式可能因地区政策、时间变化以及具体交易细节而有所不同。建议在实际操作中咨询当地税务部门或专业税务顾问以获得最准确的计算方法和结果