裸藻，也称绿虫藻。是一类介于动物和植物之间的单细胞真核生物。无细胞壁，具鞭毛，能游动。广温型，喜强光高温（20-35℃），主要生长在淡水环境中，春夏季节常在有机质较多的污水内大量繁殖，使水质成绿色。
裸藻可作为有机物污染环境的生物指标。裸藻容易倒藻，不好处理，是水产养殖过程中重点防控的种类。
裸藻水色表现
一期表现：水色变化不大，只是在下风处有绿色或褐色藻沫，是少量裸藻死亡的结果，水质指标无变化，基本正常，鱼虾摄食、生长正常。
二期表现：水色略有变化，颜色发暗，下风处藻沫很多，氨氮、亚硝态氮略有升高，水质混浊，悬浮有机质多，镜观裸藻活力差，有死体，鱼虾摄食差，但大部分能抢食，部分呈浮头状，散布于全池，无围增氧机现象。
三期表现：水色变化很大，由蓝绿色或红褐色变为灰绿色或灰褐色，下风处藻沫很多，面积很大，腥臭味很浓，悬浮的有机质多，水质混浊似稀粥状，鱼虾基本不摄食，多在水面，呈浮头状，死亡增多。
裸藻水：油膜状漂浮在水面（红色或绿色）。
甲藻
甲藻又称"双鞭甲藻"。像动物一样可以在水中自由游动，细胞内含有叶绿素，能进行光合作用，具有植物的根本特性，大多数的甲藻具有很厚的比较好分辨的细胞壁，并且又由许多的小甲片组成。甲藻为主要的浮游藻类之一，分布范围很广，淡水、半咸水、海水中都有，海生种类很多。
甲藻水色表现
甲藻喜欢生长在有机物质多、硬度大、微碱性的水体中。它们大量繁殖时，水呈红棕色俗称“红水”。甲藻为一大类鞭毛藻的总称，体呈卵圆形，大量繁殖时，常可改变其生活水域的颜色。
其中有些类群，在繁殖过程中，可产生多种毒素，引起鱼类的神经麻木，代谢失调及呼吸障碍，最后导致死亡。
卵甲藻还能附在鱼身上，过寄生生活，吸收鱼体养料，刺激鱼体增生粘液，使鱼体像涂了一层米粉似的，故称“打粉病”。
甲藻水：发红、铁锈水
裸藻、甲藻治理方法
1.传统的治理—化学消杀
二氧化氯、氯制剂等化学药物杀有害藻。
危害：①强烈的刺激性②倒藻缺氧③藻毒素大量释放
2.科学安全的方法（抑制活性、定向培藻）
物理方法＋生物方法
①改变有害藻适应的环境②提高盐度、降低pH值
补充有益藻，有益菌，分解掉死藻，使有益藻占优势。通常以生物方法为主，物理方法为辅治理。
裸藻、甲藻预防措施
1.对于经常起水华、老化、过肥的池塘，在消毒时建议使用氯制剂。2.发生裸藻时要在初期就要进行控制，不要等到中后期再进行控制。因为在前期发现裸藻及时进行处理是能控制住的，当大量繁殖起来，整个池面铺满裸藻，就不利于处理。3.老的池塘留有甲藻的“种子”沉在底泥中，因此要清淤并用微生物制剂分解。4.科学肥水，定向培养有益藻，控制有害藻类。5.注水注意，不用含甲藻丰富的水源；养殖水位不宜过浅，池塘水经常循环，以培养硅藻（小环藻）、绿藻（小球藻）等有益藻，减少甲藻、裸藻繁殖。6.定期使用微生物制剂分解有机物和死亡的藻类，避免水、底富营养化。7.高温季节合理投料，每周适当停料2-3餐。
总结
1.重预防，防大于治。2.注意用菌分解。3.科学合理用肥（忌用有机肥，粪肥）。4.慎换水。5.慎用化学药物。6.把握时机，讲究方法。7.注意虫量。